Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Atl3Q91YH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atl3Q91YH5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atl3Q91YH5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atl3Q91YH5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms