Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms