Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdha11Q91Y19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha11Q91Y19 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha11Q91Y19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha11Q91Y19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha11Q91Y19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha11Q91Y19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha11Q91Y19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha11Q91Y19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha11Q91Y19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha11Q91Y19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms