Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdhb12Q91Y07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcdhb12Q91Y07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdhb12Q91Y07 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdhb12Q91Y07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms