Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx15Q91WE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx15Q91WE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx15Q91WE1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx15Q91WE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx15Q91WE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx15Q91WE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx15Q91WE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx15Q91WE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms