Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp3Q91W36 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp3Q91W36 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp3Q91W36 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp3Q91W36 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms