Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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