Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx7Q8VDS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx7Q8VDS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx7Q8VDS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms