Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20bQ8VCS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20bQ8VCS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20bQ8VCS3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam20bQ8VCS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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