Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nxnl1Q8VC33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nxnl1Q8VC33 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxnl1Q8VC33 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxnl1Q8VC33 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxnl1Q8VC33 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nxnl1Q8VC33 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nxnl1Q8VC33 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms