Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
0610009B22RikQ8R3W2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
0610009B22RikQ8R3W2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
0610009B22RikQ8R3W2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
0610009B22RikQ8R3W2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms