Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r200Q8R281 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r200Q8R281 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r200Q8R281 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r200Q8R281 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r200Q8R281 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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