Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc137Q8R0K4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc137Q8R0K4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc137Q8R0K4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc137Q8R0K4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc137Q8R0K4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc137Q8R0K4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms