Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Paf1Q8K2T8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paf1Q8K2T8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Paf1Q8K2T8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paf1Q8K2T8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Paf1Q8K2T8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Paf1Q8K2T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms