Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Habp2Q8K0D2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Habp2Q8K0D2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp2Q8K0D2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Habp2Q8K0D2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Habp2Q8K0D2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms