Protein–RNA interactions for Protein: Q8K083

Znf536, Zinc finger protein 536, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf536Q8K083 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf536Q8K083 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf536Q8K083 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf536Q8K083 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf536Q8K083 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf536Q8K083 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms