Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pxdc1Q8JZU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pxdc1Q8JZU6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pxdc1Q8JZU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms