Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI12

Smtnl2, Smoothelin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl2Q8CI12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smtnl2Q8CI12 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smtnl2Q8CI12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smtnl2Q8CI12 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smtnl2Q8CI12 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl2Q8CI12 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl2Q8CI12 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms