Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxw17Q8CFE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxw17Q8CFE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxw17Q8CFE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fbxw17Q8CFE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxw17Q8CFE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms