Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClasrpQ8CFC7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClasrpQ8CFC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ClasrpQ8CFC7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ClasrpQ8CFC7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClasrpQ8CFC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ClasrpQ8CFC7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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