Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkiras1Q8CEC5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkiras1Q8CEC5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkiras1Q8CEC5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms