Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC106179Q8C9L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC106179Q8C9L1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms