Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfibp1Q8C8U0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp1Q8C8U0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp1Q8C8U0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp1Q8C8U0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp1Q8C8U0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfibp1Q8C8U0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms