Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uba3Q8C878 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uba3Q8C878 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uba3Q8C878 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Uba3Q8C878 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uba3Q8C878 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms