Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubqln3Q8C5U9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubqln3Q8C5U9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubqln3Q8C5U9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubqln3Q8C5U9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms