Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cwc22Q8C5N3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cwc22Q8C5N3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cwc22Q8C5N3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cwc22Q8C5N3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cwc22Q8C5N3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Cwc22Q8C5N3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms