Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa22Q8C1N8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa22Q8C1N8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa22Q8C1N8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms