Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D4

Arhgap12, Rho GTPase-activating protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap12Q8C0D4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap12Q8C0D4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arhgap12Q8C0D4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgap12Q8C0D4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgap12Q8C0D4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap12Q8C0D4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap12Q8C0D4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap12Q8C0D4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap12Q8C0D4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap12Q8C0D4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap12Q8C0D4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap12Q8C0D4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms