Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c4Q8BMQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c4Q8BMQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c4Q8BMQ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c4Q8BMQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms