Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpa1Q8BLA8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpa1Q8BLA8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpa1Q8BLA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpa1Q8BLA8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpa1Q8BLA8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpa1Q8BLA8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpa1Q8BLA8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpa1Q8BLA8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms