Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy1Q8BIJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy1Q8BIJ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rufy1Q8BIJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy1Q8BIJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy1Q8BIJ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms