Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdca8Q8BHX3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdca8Q8BHX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdca8Q8BHX3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdca8Q8BHX3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdca8Q8BHX3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdca8Q8BHX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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