Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ9

Slu7, Pre-mRNA-splicing factor SLU7, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slu7Q8BHJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slu7Q8BHJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slu7Q8BHJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Slu7Q8BHJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slu7Q8BHJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slu7Q8BHJ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slu7Q8BHJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms