Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smndc1Q8BGT7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smndc1Q8BGT7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smndc1Q8BGT7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms