Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms