Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChfrQ810L3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChfrQ810L3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChfrQ810L3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ChfrQ810L3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChfrQ810L3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChfrQ810L3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.6 ms