Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx32Q80ZJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx32Q80ZJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx32Q80ZJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx32Q80ZJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.1 ms