Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rexo1Q7TT28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rexo1Q7TT28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rexo1Q7TT28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rexo1Q7TT28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rexo1Q7TT28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms