Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ckap2lQ7TS74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ckap2lQ7TS74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ckap2lQ7TS74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2lQ7TS74 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2lQ7TS74 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms