Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf653Q6YND2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf653Q6YND2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf653Q6YND2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf653Q6YND2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf653Q6YND2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf653Q6YND2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf653Q6YND2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Znf653Q6YND2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf653Q6YND2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms