Protein–RNA interactions for Protein: Q6T707

Scd4, Acyl-CoA desaturase 4, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd4Q6T707 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scd4Q6T707 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scd4Q6T707 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scd4Q6T707 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scd4Q6T707 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.7 ms