Protein–RNA interactions for Protein: Q6R653

Unc5cl, UNC5C-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5clQ6R653 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Unc5clQ6R653 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Unc5clQ6R653 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Unc5clQ6R653 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Unc5clQ6R653 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Unc5clQ6R653 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Unc5clQ6R653 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Unc5clQ6R653 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Unc5clQ6R653 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms