Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil2Q6R2P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Neil2Q6R2P8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neil2Q6R2P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neil2Q6R2P8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms