Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NfrkbQ6PIJ4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NfrkbQ6PIJ4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NfrkbQ6PIJ4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NfrkbQ6PIJ4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.9 ms