Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pabpc4Q6PHQ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pabpc4Q6PHQ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pabpc4Q6PHQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc4Q6PHQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms