Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc82Q6PG04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc82Q6PG04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc82Q6PG04 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc82Q6PG04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc82Q6PG04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms