Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rasa4Q6PFQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rasa4Q6PFQ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rasa4Q6PFQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasa4Q6PFQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms