Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PdgfrlQ6PE55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfrlQ6PE55 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PdgfrlQ6PE55 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfrlQ6PE55 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfrlQ6PE55 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms