Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm2lQ6PDS0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vstm2lQ6PDS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vstm2lQ6PDS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vstm2lQ6PDS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vstm2lQ6PDS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vstm2lQ6PDS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms