Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo42Q6PDJ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo42Q6PDJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo42Q6PDJ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms